据中华预防医学会的抽样调查，正在使用的饮水机内含有大量的大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、霉菌、厌氧菌以及抵抗力最强的枯草芽胞杆菌。
 
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具体说来，饮水机消毒应分为以下几个步骤：

    一，拔去电源插头，取下水桶，打开饮水机后面的排污管，排净余水，因为排污管里的剩余水才是导致饮水机二次污染的关键。然后，再打开所有饮水开关放水。

    二，用镊子夹住酒精棉花，仔细擦洗饮水机内胆。饮水机内胆由于直接与空气接触，很容易积聚细菌。用酒精擦洗，可以去除上面的污垢，为下一步消毒做准备。

    三，将饮水机内胆装满水，把1片消毒片溶解到水里，并放置10—15分钟。

    四，打开饮水机的所有开关，包括排污管和饮水开关，排净消毒液。

    五，用7—8升的清水连续冲洗饮水机整个腔体，打开所有开关排净冲洗液体。有些人只用1升清水冲洗是远远不够的，会使消毒液残留在饮水机内。

    六，用酒精棉花擦洗开关处的后壁，当用杯子盛水时，很容易碰到饮水机开关处的后壁，不能只用抹布擦洗。

    饮水机消毒完后，还可能有微量的消毒液残留，不能马上饮用。应该先放一杯水，闻闻有没有氯气味。如果有，应该再放水，直到闻不出氯气味才能放心饮用。